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微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息

更新時(shí)間:2017-09-21  |  點(diǎn)擊率:1345

  近日,中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所張亞平課題組與吳東東課題組合作,通過(guò)比較野生褐家鼠和實(shí)驗(yàn)大鼠的基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),解析了實(shí)驗(yàn)大鼠的起源和馴化遺傳機(jī)制。相關(guān)研究成果發(fā)表在Molecular Biology and Evolution上。本文締一生物/締一生物為您分析微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息

   A.大豆灰斑菌的侵染循環(huán);B-D.大豆灰斑病病癥及菌絲侵染特點(diǎn);

  E.灰斑菌基因組的Circos-plot分析;F.致病基因簇

  實(shí)驗(yàn)大鼠作為一種廣泛使用的模式動(dòng)物,由野生褐家鼠馴化而來(lái),也是一種家養(yǎng)動(dòng)物。與其野生祖先褐家鼠相比,實(shí)驗(yàn)大鼠在形態(tài)、行為及生理方面發(fā)生很大變化,但實(shí)驗(yàn)大鼠的起源以及導(dǎo)致其被馴化成功的機(jī)制尚不清楚。

  研究人員利用群體遺傳學(xué)方法,F(xiàn)ST與cross-population extended haplotype homozygosity (XP-EHH)等,在全基因范圍內(nèi)掃描了野生褐家鼠與實(shí)驗(yàn)大鼠群體之間出現(xiàn)分化的區(qū)域,發(fā)現(xiàn)大量神經(jīng)系統(tǒng)基因在大鼠馴化過(guò)程中受到人工選擇作用,例如,在學(xué)習(xí)記憶方面起重要作用的FOXP2和B3GAT1,以及節(jié)律相關(guān)基因CLOCK。這些基因在實(shí)驗(yàn)大鼠的神經(jīng)組織中的表達(dá)水平顯著上調(diào),有助于提高學(xué)習(xí)記憶能力。研究人員推測(cè)學(xué)習(xí)記憶能力的提高可能是實(shí)驗(yàn)大鼠被馴化的關(guān)鍵。此外,基于轉(zhuǎn)錄組分析及qPCR數(shù)據(jù)揭示能量代謝相關(guān)基因在實(shí)驗(yàn)大鼠大腦組織中顯著上調(diào),這為進(jìn)一步揭示實(shí)驗(yàn)大鼠馴化的遺傳機(jī)制奠定了良好的基礎(chǔ)。

  該研究得到中科院先導(dǎo)B項(xiàng)目的資助。綜上所述,您是不是已經(jīng)對(duì)微生物所等解析大豆灰斑病菌基因組信息,有所了解。如果還有其他疑問(wèn),請(qǐng)咨詢締一生物/締一生物資深專家。

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